該院智慧醫療創新中心於2021年5月成立，與30家產業鏈結合作夥伴，17個國家不同產、學、研機構交流，致力推動創新科技在醫療、健康及管理領域上的應用與服務，藉由推出更先進的醫療服務體驗，進而打造友善且高效率的工作環境，獲得系統類「特色中心」肯定。

胸腔外科之肺內導引複合式定位胸腔鏡手術，藉由一站式擴增透視支氣管鏡(AFB)定位手術有效提升病人舒適度、縮短手術及住院時間，該院更於2023年9月成立亞太區胸腔介入訓練中心，促進亞太區的醫學領域跨國合作與發展，榮獲傑出醫療類「優選」。

此外，新竹臺大分院持續導入智慧醫療科技於臨床場域，以優化服務品質及病人安全。在智慧醫療類競賽，該院將2D黑白醫學影像透過Holoeyes Azure技術轉換成3D立體彩色影像搭配HoloLens 2轉換成MR醫學影像，有效縮短病情解釋、術前輔助畫刀標示時間，以改善病人住院服務流程及提升醫病溝通，故榮獲住院服務領域「優選」。此外，透過AI輔助判讀系統後之優化流程，在短時間內判讀腦部出血情況，縮短報告完成時間，榮獲「人因特別獎」及門急診服務領域「標章」。疫情期間發展運用視訊技術，讓醫師及病人透過資安檢測合格之App在不同地點進行診療活動，資料介接醫院數據資料庫，優化行動裝置之線上簽署同意書，榮獲社區服務領域「標章」認證。

2023年新竹臺大分院除了生醫醫院有亮眼表現外，新竹醫院亦不遑多讓，榮獲5項獎項，包括逐風圈以「提升腦中風再灌流治療之執行率」榮獲主題類主題改善醫學中心及區域醫院組「銅獎」；教學部、急診醫學部、護理部榮獲擬真情境類新人組「金獎」；急診醫學部、護理部榮獲急重症照護組「優選」；教學部、精神醫學部榮獲實證醫學類文獻查證新人組「佳作」；急性腸缺血照護團隊榮獲傑出醫療類「優選」。

余忠仁院長表示，新竹臺大分院肩負社會責任，努力的腳步從不停歇，未來將持續努力、不斷提升醫療品質及病人安全，朝向智慧醫療典範醫院的願景前進並邁向卓越。